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                                                        发稿时间:2020-07-07 09:32:43

                                                        什么是D614G突变?

                                                        冠状病毒广泛的宿主性以及自身基因组的结构特征使其在进化过程中易发生基因重组,呈现遗传多样性。D614G突变指的是新冠病毒的第614氨基酸位点 D(天冬氨酸)到 G(甘氨酸)的突变,位于S蛋白(图1)。D614G突变的病毒株常伴有5'UTR中的C到T突变(相对于MN908947.3基因组的241位),3037位的C到T突变;在14408位的C到T突变。包含这4个遗传连锁突变的单倍型现已成为全球优势形式,根据GISAID数据库公布的新冠病毒测序结果,发现携带该突变的病毒株主要归类于G型、GR型和GH型。

                                                        1. Korber B, Fischer W M, Gnanakaran S, et al. Tracking changes in SARS-CoV-2 Spike: evidence that D614G increases infectivity of the COVID-19 virus[J]. Cell, 2020.

                                                        据美国有线电视新闻网(CNN)7月7日报道,蓬佩奥6日在接受福克斯新闻记者劳拉·英格拉汉姆采访时提出了针对中国社交软件的可能举动,称“我们对此非常重视”。

                                                        印度通信和信息技术部近日也宣布,出于“安全”考虑,封禁包括抖音海外版TikTok在内的59款中国手机应用软件。2020年7月3日,Cell杂志的一篇研究显示29%的新冠病毒样本都出现了D164G的变异,带有该变异的病毒早已在欧洲及美洲传播,并且感染细胞的能力较前增强,是否预示病毒传播力增强和对尚未上市的疫苗造成失效风险呢?特别是北京这次疫情反弹中发现的病毒株也有这个突变,后续会对我国疫情会造成什么样的影响呢?

                                                        1)传播范围、数量以及占比方面:今年3月份之前,携带有这个突变的各型病毒株还远没有成为全球主流,仅占全球所公布的病毒株测序序列的不到10%。在欧洲最早发现后不断扩散传播到北美洲、大洋洲、南美洲以及亚洲,整个3月,这个数字猛增到了60%-70%。截止到6月底已经超过90%。 因此,携带有这个突变的病毒株已经成为了传播的主要基因型(图2)。

                                                        CNN的事实核查记者丹尼尔·戴尔也为特朗普辩护,声称总统没有犯“实质性错误”。“在提到 ‘沙漠风暴’行动时,他说 ‘大胜’一词的时候有点儿磕巴了,但他只是列举了几场战争,提到了越南,之后有些磕巴,说到了 ‘沙漠风暴’行动的全面胜利。没有事实性错误。”他写道。

                                                        英格拉汉姆询问蓬佩奥,美国是否应考虑禁止中国社交软件,尤其是TikTok的使用。蓬佩奥回答称,“关于人们手机上的中国应用程序,我可以向美国保证(会禁止),我只是不想在总统特朗普之前说出来,但这正是我们正在考虑的事。”

                                                        Korber等在英国的COVID-19病例中发现感染G614突变体病毒的患者病毒RNA水平较高,但在住院结果上没有发现差异。有学者提出D614G突变和疾病死亡率(case fatality rates)有强相关性,但仍停留在统计学的关联分析。

                                                        核酸检测上目前推荐选用针对新型冠状病毒的开放读码框1ab(open reading frame,ORF1ab)、核壳蛋白(nucleoprotein,N)基因区域的引物和探针。根据WHO指南,2019-nCoV引物和探针组设计中N3用于通用检测SARS样冠状病毒,N1和N2用于特异性检测SARS-CoV-2,因此 D614G突变不影响病毒的核酸检测。